Progetto di continuazione
I pazienti affetti da FC sono caratterizzati da una notevole eterogeneità del fenotipo clinico polmonare tanto da mostrare gradi diversi di compromissione delle funzioni respiratorie. La notevole eterogeneità del fenotipo polmonare, osservata in pazienti caratterizzati dalla presenza della stessa mutazione DeltaF508 in omozigosi, suggerisce che la perdita progressiva e diversificata delle funzioni respiratorie possa essere attribuita solo in parte al gene CFTR. Analizzando 768 SNPs (particolari varianti nel DNA genico) all’interno di 149 geni dell’immunità innata su una coorte di pazienti CF (dal “North American Consortium“) abbiamo identificato 3 SNPs che rappresentano 3 potenziali geni modificatori del fenotipo polmonare. Lo scopo di questo progetto sarà caratterizzato da due punti fondamentali: identificare nuovi geni modificatori su pazienti omozigoti DF508 provenienti da due diverse coorti, la prima di origine italiana, mentre la seconda è fornita dal Centro Nazionale Fibrosi Cistica di Praga; i 3 potenziali geni modificatori ottenuti dallo studio dei pazienti CF del North America verranno analizzati sia sulla coorte di pazienti CF italiana che su quella della Repubblica Ceca.
I risultati attesi permetteranno di comprendere meglio i meccanismi che caratterizzano il fenotipo polmonare della CF, in particolare sarà possibile identificare i potenziali geni “master”, e le terapie indirizzate a modulare l’evoluzione negativa del fenotipo polmonare.
Cystic Fibrosis patients present a great heterogeneity in the clinical course of lung disease, which greatly affect the degree of respiratory insufficiency. This heterogeneity, observed also among CF patients who are homozygous for the most common severe mutation DF508, suggests that the variable course of lung disease can be attributed only in part to the specific genotype in the CF locus.
Preliminary results obtained on a North American group of CF DF508 homozygous patients by analyzing 768 SNPs localized in 149 genes of the innate immunity, allowed us to identify 3 potential candidate SNPs to be considered as modifiers of the lung phenotype.
The aim of this project is to identify new modifier genes of CF lung phenotype using two different molecular approaches:
Whole genome screening for the identification of new modifier genes in Italian and Czech DF508 homozygous CF patients, characterized by a more homogeneous genetic background when compared to the North America patients
Replication of the results obtained on the North American CF patients in the two selected groups of Italian and Czech patients for the screening of the 3 potential modifier genes identified in the previous study
Results will lead to gain further insights on the mechanisms of CF lung pathology, in particular on the identification of potential “master” gene(s), and address therapeutic perspectives aimed to modulate the detrimental inflammatory status in the airways of CF patients.
