L’ipotesi della ricerca è che per combattere più efficacemente il declino della funzionalità respiratoria FC sia necessario conoscere meglio l’insieme dei microbi presenti nelle vie aeree (microbioma). In un precedente progetto si è visto che alcuni agenti microbici e i loro marcatori genetici risultano associati ad un peggior andamento polmonare. Si vuole ora caratterizzare con tecniche avanzate il microbioma che colonizza le vie aeree dei pazienti FC, individuare nuovi microbi ad oggi sconosciuti, indagare più estesamente quali di essi si associno a peggiore o migliore andamento del quadro respiratorio, predisporre uno strumento diagnostico di uso pratico basato sul pannello delle nuove conoscenze microbiologiche. La sua applicazione nei pazienti FC potrebbe riuscire a distinguere i pazienti a maggiore o minore rischio di peggioramento e fornire un valido aiuto alla personalizzazione della terapia antibiotica. Continuazione del Progetto FFC#8/2012.
CF is characterized by a progressive decline in lung function. Interpreting the significance of changes in % FEV1 over time requires a more indepth comprehension of the airway microbiome in patients with a substantialdecline in lung function, and the assessment of whether a pathogen is only a marker of the disease severity or an independent contributor to the lung function loss. In theproject FFC#8/2012, potential biomarkers related to FEV1 decline have been already identified and a large set of metagenomic data were produced.The specific aims of this project are to perform bioinformatics analysis of airway metagenomes sequenced and to identify additional biomarkers (in terms of both opportunistic non-culturable pathogens and gene functions) related to the serious decline in lung function; to set-up diagnostic tools based on the already and the newly identified biomarkers for the identification of substantial decliners in lung function.In this way we think that a more personalized antibiotic strategy could be applied to CF patients.
